Nanobind Plant Nuclei Big DNA Kit slouží k rychlé extrakci velmi dlouhých fragmentů DNA z rostlinných jader. Byl testován na řadě rostlin, jako je locika setá, lilek rajče, lilek paprika, levandule, pšenice, celer, vinná réva nebo kukuřice. Izolace využívá magnetické disky s nanostrukturovaným křemičitým povrchem, které chrání DNA před mechanickým namáháním a umožňují šetrné promývání. Výsledkem je nejdelší a nejčistší izolovaná DNA vhodná pro long-read sekvenování.

Izolovaná DNA se osvědčila při sekvenování na platformách Oxford Nanopore a PacBio. Dlouhou DNA (i 300+ kb) lze získat za méně než 1 hodinu od stádia jaderných pelet. Typické výtěžky jsou 5–20+ μg na extrakci v závislosti na množství vstupního materiálu.

Balení obsahuje:

• proteináza K
• RNáza A
• jaderný lyzační pufr PL1
• promývací pufr PW1
• eluční pufr EB
• 20x MagNanobind disky.

Pro izolaci jader můžete použít vlastní protokol nebo jeden z protokolů doporučených výrobcem:

• Workman et al., Protocol Exchange (2018) DOI: 10.1038/protex.2018.059
• Zhang et al., Nature Protocols (2012) DOI: 10.1038/nprot.2011.455.