MSC-3000 je uzavřená varianta mikrocentrifugy se zabudovaným portem pro vortex na vrchu přístroje. Tento přístroj v sobě spojuje dva přístroje pro manipulaci s mikrozkumavkami - funguje jako centrifuga a jako vortex až 12 zkumavek najednou. Oba módy lze použít separátně nebo použít jejich kombinaci např. v podobě patentovaného "sms algoritmu". Tento algoritmus vzniknul za účelem stočení mikroobjemů reagencií na dno destičky (první stočení), následuje promíchání (třepání) a opětovné stočení reagencií ze stěn mikrodestičky (druhé stočení), čímž je dokonale odstraněna chyba při pipetování. Standardně je tento přístroj dodáván se dvěmi hlavicemi v ceně, a to R-1,5 rotor pro 12 x 1.5/2 ml mikrozkumavek a R-0,5/0,2 rotor pro 12x 0,5 ml a 12x 0,2 ml mikrozkumavek. Přináší možnost dokoupit širokou škálu jiných rotorů, viz doporučené příslušenství níže.
