Nové kity Maxwell® DNA/RNA z FFPE vzorků: Jeden kit na extrakci, navázání, promytí a eluaci nukleových kyselin!

Extrakce nukleových kyseliny z FFPE řezů je náročnou disciplínou. U FFPE řezů působí obtíže vysoký stupeň zesíťování s proteiny a degradace DNA i RNA. Maxwell XtractAll FFPE Kit je novým řešením, které umožňuje izolaci RNA, DNA, TNA nebo sekvenčně DNA i RNA z jednoho vzorku pomocí jediné izolační kazety. Druhým náročným typem vzorku je ccfDNA, kde se naráží na problém nízké koncentrace a nutnosti pracovat s většími objemy plazmy. Maxwell Rapid ccfDNA je flexibilní kit pracující s 1-4 ml plazmy bez nutnosti předúpravy vzorku. S oběma kity vás detailně seznámíme v našem dalším článku.

Automatický izolátor nukleových kyselin Maxwell je kompaktním přístrojem, který využívá separaci pomocí magnetických částic magnetických tyčí. Vzorky se dávkují do předplněných kazet a magnetické tyče s návlekem následně přenáší částice s navázanou nukleovou kyselinou mezi jednotlivými promývacími roztoky až do elučního roztoku. Díky tomu, že stroj nevyužívá pipetování, nehrozí žádné ucpávání nebo úniky kapalin kvůli špatně nasazené či ucpané špičce. Díky tomu jsou přístroje Maxwell velmi spolehlivé a skladné.

Maxwell RSC.png

Obr. 1 Automatický izolátor nukleových kyselin Maxwell RSC - varianta určená pro 1-16 vzorků a výzkumné aplikace

Promega nabízí kity pro izolaci DNA i RNA z celé řady matricí od běžných klinických vzorků jako je plná krev, plazma nebo stěry, po složitější vzorky, jako je stolice nebo rostlinná pletiva. Nově uvádí Promega na trh dva nové kity na rychlou velkoobjemovou izolaci cirkulující DNA (ccfDNA) a rychlou univerzální izolaci RNA i DNA z FFPE řezů. Maxwell Rapid ccfDNA i XtractAll FFPE kity nabízejí velmi rychlé a jednoduché protokoly s žádným nebo minimálním preprocessingem, které vám uvolní ruce a můžete se tak soustředit na další práci v laboratoři.

Maxwell RSC Rapid ccfDNA Kit – rychlá a spolehlivá izolace cirkulující DNA z plazmy

ccfDNA je klíčovým analytickým materiálem v oblastech jako je neinvazivní prenatální testování (NIPT), tekutá biopsie v onkologii, monitorování léčby či detekce rejekce transplantátů. Pro izolaci se většinou používají kolonkové manuální metody, které umožňují použít větší vstupní objemy plazmy nebo kity na bázi paramagnetických částic s nutností předúpravy vzorku. Maxwell® RSC Rapid ccfDNA Kit (kat.č. AS1590) od společnosti Promega představuje moderní řešení pro efektivní izolaci ccfDNA z lidské plazmy. Tento kit umožňuje rychlou a plně automatizovanou extrakci na přístroji Maxwell® RSC, díky čemuž poskytuje čistou a vysoce kvalitní DNA pro pokročilé molekulárně biologické aplikace. Umožňuje zpracování 1 až 4 ml plazmy najednou, což je dostatečné množství pro získání potřebné výtěžnosti DNA i pro náročné analýzy v rámci NIPT testování. A to vše bez jakéhokoliv preprocessingu.

Rychlý a standardizovaný pracovní postup

Celý izolační proces trvá přibližně 45 minut a je plně automatizován na systému Maxwell® RSC, bez nutnosti ručního přenosu, centrifugace nebo filtrace. To zajišťuje maximální ochranu vzorku, omezení lidských chyb a vysokou mezioperační reprodukovatelnost. Výsledná ccfDNA má typickou fragmentaci kolem 170 bp, což je ideální pro aplikace jako qPCR, ddPCR nebo sekvenování nové generace (NGS).

rapid ccfdna kit.jpgObr. 2 Maxwell® RSC Rapid ccfDNA Kit má méně kroků a rychlejší, jednodušší pracovní postup než konkurenční sady pro izolaci ccfDNA. V kombinaci se spolehlivou automatizací přístroje Maxwell® to znamená méně ruční práce, nižší riziko chyb a rychlejší výsledky.

Hlavní výhody Maxwell® RSC Rapid ccfDNA kitu:

  • Rychlá izolace během 45 minut
  • Variabilní vstupní objem vzorky od 1 až 4 ml plazmy
  • Vysoká výtěžnost DNA vhodná i pro NIPT a další náročné aplikace
  • Automatizace na Maxwell® RSC přístroji – bez potřeby manuálních kroků
  • Kompatibilita s downstream metodami: qPCR, ddPCR, NGS
  • Bez použití organických rozpouštědel, minimální spotřeba reagencií
  • Vysoká čistota a integrita DNA

Ideální volba pro klinické i výzkumné laboratoře

Maxwell® RSC Rapid ccfDNA Kit je ideálním nástrojem pro klinické laboratoře, které vyžadují rychlé, opakovatelné a vysoce kvalitní výsledky, například v rámci prenatální diagnostiky (NIPT) nebo onkologického screeningu. Jeho jednoduchost, rychlost a výkonnost z něj činí perfektní volbu i pro rutinní analýzy i špičkový výzkum.

Maxwell RSC XtractAll FFPE DNA/RNA kit – flexibilní izolace DNA i RNA z jednoho řezu

Maxwell® RSC XtractAll FFPE DNA/RNA Kit (kat.č. AS1570) od společnosti Promega představuje moderní a vysoce efektivní řešení pro izolaci nukleových kyselin z formalinem fixovaných a parafínem zalitých (FFPE) tkáňových vzorků. FFPE materiál je běžně využíván v klinických i výzkumných laboratořích, ale jeho zpracování může být komplikované kvůli degradaci a kovalentním změnám nukleových kyselin. Tento kit však tyto překážky překonává pomocí optimalizovaného protokolu a automatizovaného systému Maxwell® RSC.

Maximální flexibilita pro různé potřeby izolace

Jedinečnost tohoto kitu spočívá v jeho flexibilním workflow, které umožňuje z jednoho FFPE vzorku izolovat buď pouze DNA, pouze RNA, celkovou TNA nebo sekvenčně izolovat DNA a RNA z jednoho vzorku v jediném běhu.

xtractall ffpe kit.png

Obr. 3 Pracovní postupy s kitem Maxwell® RSC XtractAll FFPE DNA/RNA. Po přípravě lyzátu z FFPE tkáňového vzorku si můžete zvolit, zda chcete izolovat DNA, RNA, celkové nukleové kyseliny (total NA), nebo provést sekvenční izolaci DNA a RNA. Bez ohledu na zvolený pracovní postup je potřeba pouze jedna kazeta na vzorek. Tento kit maximalizuje flexibilitu a efektivní využití omezených FFPE vzorků a zároveň minimalizuje odpad.

Tato flexibilita je zvláště výhodná při práci se vzácnými nebo limitovanými vzorky, kdy si uživatel nemůže dovolit ztratit cenný biologický materiál. Navíc je celý postup navržen tak, aby vyžadoval pouze jednu kazetu na vzorek, bez ohledu na zvolený režim izolace, což snižuje náklady a eliminuje zbytečný odpad.

Spolehlivý výkon v kombinaci s automatizací

Ve spojení s automatizační platformou Maxwell® RSC je celý proces izolace výrazně zjednodušen – uživatel vloží lyzovaný vzorek a přístroj se postará o zbytek. Výsledkem je:

  • vysoká výtěžnost i z problematických nebo starších FFPE bloků,
  • minimální manuální zásahy, čímž se snižuje riziko lidských chyb,
  • kvalitní a čisté nukleové kyseliny, vhodné pro následné molekulárně-biologické analýzy.

Výhody Maxwell® RSC XtractAll kitu:

  • Flexibilní izolace: DNA, RNA nebo total NA z jednoho vzorku
  • Optimalizováno pro přístroje Maxwell® RSC
  • Kompatibilita s downstream metodami: PCR, qPCR, RT-PCR, NGS a další
  • Bez nutnosti použití organických rozpouštědel
  • Vysoká reprodukovatelnost výsledků a minimální kontaminace
  • Ideální pro diagnostiku, výzkum i archivní analýzy

Ideální volba pro náročné laboratorní prostředí

Ať už pracujete v klinické genetice, patologii, onkologickém výzkumu nebo jiném oboru, kde se zpracovávají FFPE vzorky, Maxwell® RSC XtractAll FFPE DNA/RNA Kit vám poskytne rychlý, efektivní a reprodukovatelný nástroj, který šetří čas i náklady a zároveň chrání vzácný biologický materiál.

Chcete vědět víc?

Pokud je některá z těchto aplikací kritická pro vaši laboratoř a bojujete s aktuálně používanými metodami. Rádi vám poskytneme bližší informace k oběma kitům, případně domluvíme bezplatné zapůjčení demo přístroje, abyste se o kvalitě Maxwell® izolátorů i kitů mohli přesvědčit na vlastní kůži.