Nový dodavatel siTOOLS – experti na RNA
Zahajujeme spolupráci s firmou siTOOLs. Tento německý startup vyvíjí reagencie pro výzkum RNA. Jejich vlajkovým produktem je patentovaná technologie siPOOLs, která řeší jinak častý problém off-target efektů v RNAi experimentech.
East Port navázal spolupráci s německou firmou siTOOLs, jejíž výrobky se hodí všem, které zajímá regulace genové exprese, studium funkce proteinů nebo transkriptomika. V následujícím článku představíme nejdůležitější produkty siTOOLs a pokud Vás jejich řešení pro RNAi nebo RNA pulldown zaujme, rádi doplníme podrobnější informace pro konkrétní aplikace.
Jedná se o čerstvou spolupráci, takže portfolio siTOOLs ještě zpracováváme pro web East Portu. Dočasně proto pro hledání doplňujících informací použijte přímo web siTOOLs. Veškeré produkty máme k dispozici a můžeme na ně ihned vystavit cenovou nabídku. U většiny položek existují i speciální malá balení pro testování.
1. siPOOL
Chcete se vyhnout složitým validacím vaší siRNA a opakování experimentů s různými siRNA? Pool třiceti optimálně navržených siRNA zajistí efektivní knockdown vybrané mRNA bez off-target efektů (zásadní rozdíl oproti typickému poolu čtyřech siRNA). Pool je finančně výhodnější než nákup několika jednotlivých siRNA a zajistí neprůstřelnost experimentů z pohledu recenzentů během peer review. siPOOLs cílené na několik tisíc nejčastěji silencovaných mRNA jsou ihned připravené k odeslání, jinak je pool možné navrhnout proti kterémukoli anotovanému transkriptu z jakéhokoliv organizmu. Tato technologie je ideální i pro screeningové projekty. Off-target efekty můžou snadno přivést váš výzkum do slepé uličky, odkud se dostat zpět na správnou cestu stojí spoustu času a peněz, takže investice do patentované technologie siPOOLs se jednoznačně vyplatí.
2. riboPOOL
Hledáte elegantní způsob, jak se zbavit ribozomální RNA před RNA-seq? riboPOOL je flexibilní a cenově dostupné řešení. Tato komplexní směs biotinylovaných DNA oligonukleotidů odstraní více než 95 % cytoplazmatické i mitochondriální rRNA. K dispozici jsou připravené pooly pro všechny běžně studované organizmy a pro jakýkoli exotický organizmus je možné vyrobit kit na zakázku, pokud má známé sekvence ribozomální RNA. V nabídce máme i směsi jako např. pan-prokaryotní pool pro metagenomické aplikace. Princip riboPOOL lze adaptovat i na jiné RNA, např. globinovou RNA v případě krevních vzorků nebo SARS-CoV-2 RNA při studiu genové exprese nakažených buněk. Odstranění nežáoucí RNA ze vzorku nabízí siTOOLs i jako servis. Odstranění rRNA nevnáší do transkriptomických dat bias tak jako selekce polyadenylovaných RNA, nehledě na to, že zdaleka ne všechny potenciálně zajímavě RNA polyA konec mají.
3. raPOOL
Zajímají vás, s čím interaguje vaše oblíbená RNA? raPOOL umožňuje afinitní purifikaci libovolné mRNA nebo lncRNA v komplexu s RNA-vazebnými proteiny a nukleovými kyselinami. Díky této optimálně navržené směsi biotinylovaných DNA oligonukleotidů docílíte stonásobného nabohacení vaší cílové RNA pomocí purifikace na streptavidinem pokrytých magnetických částicích.
4. Servis
Outsourcujte celý svůj RNAi screening nebo RNA-seq experiment. Obzvlášť pokud nejste na tyto experimentální přístupy experty, je outsourcing nejefektivnější a nejlevnější řešení. Budete mít jistotu, že dostanete výsledky v řádném termínu, rovnou zanalyzované a pečlivě dokumentované.
Shrnutí nabídky siTOOLs můžete zhlédnout také na následujícím krátkém videu. Produktům siTOOLs můžete věřit, používají je nejen vědci z akademických institucí, ale i firmy jako Roche, J&J nebo Bayer.
Rychlý kontakt: Ing. Vojtěch Ledvina, Ph.D. +420 725 320 796, vojtech.ledvina@eastport.cz