Unikátní kombinace účinných technologií, se zaměřením na ribozomální RNA pro determinaci bakteriálních druhů, různých typů kvasinek a plísní.
microCompass™ test poskytuje počet bakteriální RNA pomocí Real Time, Reverse Transciptase (RT) PCR. Tradiční PCR metody se zaměřují pouze na DNA. Testování RNA zajišťuje vyšší senzitivitu a garantuje detekci pouze živých organismů.
microCompass™ systém poskytuje přesná data založená na molekulární biologii, která umožňují získat výsledky do 4 hodin. Nabízí mnoho výhod jako je automatizace, rychlé výsledky, žádné obohacování původního vzorku a reprodukovatelné výsledky. Očekávaná senzitivita systému je 100 cfu na vzorek nebo 1 cfu/ml se 100 ml vzorku. microCompass™ systém zahrnuje následující přístroje: Mechanický lyzační systém, RNA extrakční robot a R.A.P.I.D.® LT Thermal Cycler.
microCompass™ RNA extrakční kit je vhodný pro extrakci a purifikaci celkové RNA z bakterií, kvasinek a plísní. Vzorky jsou filtrovány přes microCompass™ rotační filtrační jednotku, pak je přidán RNA Booster pro vyvážení poolu ribozomální RNA. Mikroorganismy jsou lyzovány za použití kombinace mechanické a chemické lýze. Izolace celkové RNA je automatizována na robotické platformě za použití paramagnetických kuliček. Nakonec je purifikovaná RNA eluována do 96 jamkové destičky, připravena pro real time RT-PCR. RNA extrakční kit obsahuje lyzační pufr, vazebný pufr, lyofilizovanou DNázu, DNase pufr, promývací pufr, eluční pufr a microCompass™ lyzační zkumavky.
microCompass™ detekční kity obsahují všechny reagencie pro detekci bakteriální nebo kvasinkové a plísňové RNA. Kadždý kit se používá s Tth DNA polymerázou, termostabilním enzymem s RNA-dependetní reverzně transkriptázovou aktivitou a DNA-dependentní polymerázovou aktivitou, umožňující kombinaci reverzní transkripce a PCR v jedné reakční zkumavce. Amplikony jsou detekovány použitím MGB™ próbou a měřeny monitoringem výsledného fluorecenčního signálu. Senzitivita je 50fg RNA. Celková senzitivita testu (včetně zpracování vzorku a RNA extrakce) závisí na počátečním objemu vzorku.
Metoda je založená na detekci univerzálních sekvencí RNA (bakterie nebo spory) za použití one-step Real Time RT-PCR a MGB™ Eclipse probe technologie. Detekované univerzální sekvence jsou založeny na ribozomální 16S rRNA (bakterie) a 18S rRNA (kvasinky a plísně). Ribozomy hrají důležitou roli v syntéze proteinů a detekce těchto RNA odráží proteinovou syntézu a viabilitu mikroorganismů. Detekční kit obsahuje pufr, primery a dehydratovanou RNA pozitivní kontrolu a Tth enzym je dodáván samostatně.
microCompass™ je ideální pro aplikace v monitoringu prostředí, monitoringu bioburden, testování účinnosti ochranných prostředků a testování finálních produktů. Je excelentním řešením pro:
Získejte miroorganismy z filtrovatelného vzorku za použití 0,2 mikronového filtru rotační filtrací. RNA booster je přidán pro vyvážení poolu ribozomální RNA. (Alternativní protokol je dostupný pro nefiltrovatelné vzorky)
Resuspendujte mikroorganismy v lyzačním pufru, přeneste do lyzační zkumavky a umístěte do mechanického lyzačního systému. Kombinace mechanické lýze a lyzačního pufru rozrušuje buňky a spory a uvolňuje nukleové kyseliny ze vzorku.
Po lýze je vzorek přenesen do 96 jamkové destičky. Destičky jsou umístěny do RNA extrakčního robota. RNA se váže na povrch magnetických kuliček a je purifikovány sérií promývacích kroků.
Extrahovaný vzorek RNA a PCR reagencie jsou přidány do kapilárních zkumavek.
Uzavřené kapilárky jsou umístěny do karuselu a do Termálního cykleru. Termální cykler generuje real-time PCR report.
