Oligonukleotidy pro antisense in vivo aplikace jsou zcela odblokovány, odsoleny a HPLC purifikovány. Neobsahují cytotoxické meziprodukty a jsou připraveny k okamžitému použití pro pokusy s buněčnými kulturami. Díky chemické modifikaci v cukr-fosfátové oblasti jsou PTO oligonukleotidy více než 100x rezistentnější vůči intracelulárním nukleázám než normální DNA oligonukleotidy. Specifická inhibice transkripce/translace tak může být velice efektivní. Antisense oligonukleotidy jsou dodávané v těchto škálách syntézy: 0,2; 1 a 10 µmol.